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在現(xiàn)有的技術(shù)中分辨龜?shù)墓福鄶?shù)以外形為主，或者以內(nèi)窺鏡、腹腔鏡直接觀察它的生殖系統(tǒng)。

在家庭飼養(yǎng)的環(huán)境下，龜幼齡的時候很難分辨公母，到了亞成年或者到了成年以后，公母在體型上的變化就會慢慢顯現(xiàn)。首先，雄性的尾根會比較粗，尾巴比較長，并且泄殖孔多數(shù)在背甲以外。雌性尾巴相對短小，泄殖孔多數(shù)在背甲以內(nèi)。

雄性的巴西龜有一個很明顯的特征，是在成年之后，它的指甲會非常的長，這也是雄性的一個最基本的特征。雄性的體型和雌性也會差得非常多，雄性一般偏小，成年之后多數(shù)在250-500g不等，雌性多數(shù)能夠長到1000g，有的大一點(diǎn)甚至長到2000g。